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植物表型組學(xué)的展望-WIWAM植物表型成像系統(tǒng)

更新時間:2019-06-04 點擊量:1848

表型組學(xué)是突破未來作物學(xué)研究和應(yīng)用的關(guān)鍵研究領(lǐng)域,通過表型分析來描述關(guān)鍵性狀可以為育種、栽培和農(nóng)業(yè)實踐提供基于大數(shù)據(jù)的決策支持。但是,沒有針對性的全表型標(biāo)記在植物研究領(lǐng)域中是沒有太多實際意義的。即使只針對某一個物種,全表型測量會產(chǎn)生海量、無重點的數(shù)據(jù)集。在今后相當(dāng)長的時間內(nèi)數(shù)據(jù)解析方法很難從這類數(shù)據(jù)集中地總結(jié)共性規(guī)律。并提取有生物學(xué)意義的信息。對于希望在植物研究中使用表型組學(xué)的團(tuán)隊而言,這樣的科研方式也是比較低效的。因此,表型組研究需要明確的目標(biāo)是在快速篩選關(guān)鍵性狀集的基礎(chǔ)上,為針對性解決科學(xué)問題提供決策數(shù)據(jù),體現(xiàn)研究的實際應(yīng)用價值,需重點指出的是表型組學(xué)研究不等同于表型儀器的購置,各類表型設(shè)備只是完成了數(shù)據(jù)采集工作而真正對生物學(xué)有意義的表型組信息需要由跨學(xué)科團(tuán)隊的緊密合作來完成,無論是利用F1/F2等分離群體開展植物數(shù)量性狀位點分析。還是利用近等基因系等開展基因克隆研究,選擇表型設(shè)備和分析手段應(yīng)明確目的,即為更好解決具體的生物學(xué)問題服務(wù)。

表型組學(xué)的巨大潛力還體現(xiàn)在其與其他組學(xué)研究。如基因組學(xué)、表觀組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)和離子組學(xué)等)知識的綜合分析。量化分析特定表型的遺傳規(guī)律。對作物細(xì)胞、器官、群體不同層次的監(jiān)控,作物在不同發(fā)育階段的動態(tài)性狀的獲取,并與其他組學(xué)分析結(jié)果融合,可對重要生命過程進(jìn)行多方位的解釋,中國幅員遼闊各地區(qū)實際情況差別較大,有必要針對不同生態(tài)環(huán)境中的作物表型組和其他組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合和交叉驗證,揭示農(nóng)業(yè)植物生物學(xué)規(guī)律切實支撐中國各類作物的生理學(xué)、發(fā)育學(xué)、遺傳學(xué)、育種、栽培以及農(nóng)業(yè)大田生產(chǎn)等研究提升中國作物遺傳育種、栽培管理和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)服務(wù)能力。

WIWAM植物表型成像系統(tǒng)由比利時SMO公司與GHent大學(xué)VIB研究所研制生產(chǎn),整合了LED植物只能培養(yǎng)、自動化控制系統(tǒng)、葉綠素?zé)晒獬上駵y量分析、植物熱成像分析、植物近紅外成像分析、植物高光譜分析、植物多光譜分析、植物CT斷層掃描分析、自動條碼識別管理、RGB真3D成像等多項*技術(shù),以優(yōu)化的方式實現(xiàn)大量植物樣品以優(yōu)化的方式實現(xiàn)大量植物樣品——從擬南芥、水稻、玉米到各種其它植物的生理生態(tài)與形態(tài)結(jié)構(gòu)成像分析,用于高通量植物表型成像分析測量、植物脅迫響應(yīng)成像分析測量、植物生長分析測量、生態(tài)毒理學(xué)研究、性狀識別及植物生理生態(tài)分析研究等。

SMO是歐洲的機(jī)械設(shè)備制造與設(shè)計工程公司,是一家將大規(guī)模自動化理念和工業(yè)零件和設(shè)備整合入植物成像系統(tǒng)的廠家,在機(jī)械自動化以及機(jī)械視覺成像領(lǐng)域擁有豐富的設(shè)計和實踐經(jīng)驗,為歐洲客戶提供機(jī)械設(shè)計解決方案,SMO公司將機(jī)械領(lǐng)域的*理念帶入了植物表型機(jī)器人領(lǐng)域,所采用的配件均為工業(yè)界廣泛認(rèn)可的高品質(zhì)配件,耐受苛刻環(huán)境,另外表型設(shè)備領(lǐng)域的諸多自動化配件,均由SMO公司自主設(shè)計,因公司擁有極為強(qiáng)大的工程師團(tuán)隊,基于工業(yè)領(lǐng)域的豐富經(jīng)驗,可針對不同客戶需求,一般2-3周就可以提供極復(fù)雜表型成像系統(tǒng)的解決方案。目前WIWAM植物表型平臺分為WIWAM XY,WIWAM Line以及WIWAM Conveyor 3個系列。同時還可提供WIWAM Boxing柜式成像系統(tǒng),也提供野外表型成像系統(tǒng)設(shè)計方案。

WIWAM植物表型成像系統(tǒng)的優(yōu)勢

    所有表型平臺均為SMO工程部門自主設(shè)計、針對課題組的研究項目快速、準(zhǔn)確提供技術(shù)方案,設(shè)備中諸多備件為自主生產(chǎn)和設(shè)計

    公司軟件設(shè)計團(tuán)隊針對具體項目提供有針對性的WIWAM定制軟件

    SMO和VIB自主開發(fā)PAPPA數(shù)據(jù)管理、視覺成像和分析軟件,系統(tǒng)處理整個實驗設(shè)計的大數(shù)據(jù)

    PIPPA軟件可安裝在網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器上,網(wǎng)絡(luò)中每個計算機(jī)均可操作

    在PIPPA軟件內(nèi),可集合整合外來分析數(shù)據(jù)和文本

    易于獲取數(shù)據(jù)庫和原始圖像數(shù)據(jù)

    與客戶自有IT技術(shù)設(shè)施進(jìn)行整合

    針隊客戶對表型設(shè)備運行環(huán)境了解欠缺的事實,提供表型設(shè)備生長室、室溫建設(shè)交鑰匙設(shè)計方案,實現(xiàn)環(huán)境參數(shù)。

    專門技術(shù)人員維護(hù)設(shè)備、定期指導(dǎo)維護(hù)硬件

    *代理密溝通服務(wù)、提供支持反饋

    自主電路設(shè)計、建筑內(nèi)電柜設(shè)計、機(jī)械電纜布線以及PLC管理所有室內(nèi)設(shè)計,將工業(yè)領(lǐng)域理念灌輸?shù)娇蒲兄?/span>

    采用開放式框架設(shè)計,整合世面上的所有種類成像模塊。

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